Secondo me, considerato che per sostituire sda avrai un fermo macchine obbligatorio per reinstallare il sistema, conviene rivedere la configurazione dei dischi, presupponendo che i tuoi backup siano aggiornati.
Considera anche che il problema potrebbe essere causato da altro, a.e. CPU, memoria non sufficiente, swap
in dmesg dovrebbe esserci anche un trace, magari ci da più opzioni di manovra.